A Assembleia é o órgão responsável pela definição das linhas orientadoras da atividade da unidade orgânica.
A Assembleia de Escola da EBI de Água de Pau é composta pelos seguintes elementos:
Maria Odília Mancebo (Presidente da Assembleia de Escola e Representante do Pessoal Docente do 3.º CEB)
Hermínia Rodrigues (Presidente do Conselho Executivo)
Paulo Martins (Presidente do Conselho Pedagógico)
Beatriz Lopes (Representante do Pessoal Docente do 2.º CEB)
José Figueira (Representante do Pessoal Docente do 3.º CEB)
Mara Silva (Representante do Pessoal Docente do EPE)
Marcos Mota (Representante do Pessoal Docente do 1.º CEB)
Fábio Moniz (Representante do Pessoal de Ação Educativa)
Carlos Guimarães (Representante do Pessoal de Ação Educativa)
Graziela Medeiros (Presidente da Associação de Pais e Encarregados de Educação da EBIAP)
Cristina Medeiros (Representante de Pais e Encarregados de Educação designada pela Associação de Pais e Encarregados de Educação da EBIAP)
Albertina Maria Costa Oliveira (Representante da Autarquia)